| 序号 | 课题名称 | 负责人 | 起止时间 | 经费 （万元） | 类别 |
| 1 | 蛋白质修饰组的高维度鉴定及其功能网络 | 何庆瑜 | 2017-2022 | 3124 | 国家重点研发计划项目 |
| 2 | 深度覆盖的蛋白质组精准鉴定与定量新技术 | 张弓 | 2017-2022 | 797 | 国家重点研发计划 |
| 3 | 新型蛋白质PTM在肿瘤发生发展中的功能机制研究 | 李斌 | 2017-2022 | 105 | 国家重点研发计划子课题 |
| 4 | 肺癌癌变机理及肺癌精准治疗方案的研究 | 陈良 | 2018–2020 | 100 | 广州市科技计划项目 |
| 5 | 基于蛋白质组学的食管癌转移蛋白筛选与MEST功能机制研究 | 李斌 | 2020-2023 | 100 | 国家自然科学基金国际（地区）合作与交流项目 |
| 6 | miR-31丢失导致FIH/ORP4L表达在髓性白血病干细胞（LSCs）能量代谢中的关键作用及基于ORP4L清除LSCs先导化合物的发现 | 闫道广 | 2017-2020 | 100 | 广东省自然科学基金重大研究计划 |
| 7 | 肺炎链球菌SPD_0310蛋白介导的转铁机制及其在细菌毒力方面的功能研究 | 孙雪松 | 2020-2023 | 66 | 国家自然科学基金面上项目 |
| 8 | 酶促产生的25-OHC对血管壁巨噬细胞增殖凋亡及动脉粥样硬化进程的影响和ORP4L介导作用机制的研究 | 闫道广 | 2018-2021 | 65 | 国家自然科学基金面上项目 |
| 9 | 细胞周期调节因子KCTD12的发现及其调控机制 | 何庆瑜 | 2018-2021 | 60 | 国家自然科学基金面上项目 |
| 10 | ZBED2/STAT5A/ILK信号通路促进食管癌转移的功能机制及临床意义研究 | 李斌 | 2018-2021 | 60 | 国家自然科学基金面上项目 |
| 11 | 靶向ARF1-ERK-Drp1信号通路的氮卓斯汀抑制线粒体分裂和结直肠癌生长的作用及机制研究 | 李斌 | 2020-2023 | 55 | 国家自然科学基金面上项目 |
| 12 | 非小细胞肺癌干性抑癌基因的系统筛选及机理解析 | 陈良 | 2020-2023 | 55 | 国家自然科学基金面上项目 |
| 13 | 系统干预翻译起始效率以对抗肺癌细胞恶性表型的药理学机制研究 | 王通 | 2020-2023 | 55 | 国家自然科学基金面上项目 |